المجموعات
مجموعة الكتب النادرة
خصصت مكتبة الجامع قسمًا لمجموعتها الفريدة من أندر الكتب في العالم، تضم كتباً ذات قيمة تاريخية لم يبق منها في العالم سوى نسخ محدودة جدًا.
تعرض المكتبة مجموعة منها على منصات خاصة مرفقة بملخصات تتيح للزائر الاطلاع على ما تنطوي عليه من ثراء ثقافي. وتتمحور موضوعات الكتب النادرة حول تاريخ وآثار العمارة الإسلامية في الشرق الأوسط، وشبه الجزيرة الهندية، وإسبانيا وغيرها، يعود أقدمها للقرن الثامن عشر، وهو ما يعد إضافة نوعية لمكتبة الجامع.
مجموعة المخطوطات
تقدم مكتبة الجامع لمرتاديها من المهتمين بالثقافة الإسلامية، مجموعة من نفائس المخطوطات في هيئة مصغرات فلمية يبلغ مجموعها أكثر من 50 ألف مصغرة فلمية تفصح عن ثراء الثقافة الإسلامية وعلومها المختلفة، وفنونها المتنوعة، التي استنارت بها البشرية على مر العصور، وتزود الباحثين بمعلومات في مجالات العلوم الإسلامية المختلفة كالسير الذاتية والحديث والفنون الإسلامية، كما تتضمن طبعات من القرآن الكريم، طبعت في أوروبا خلال الفترّة الزمنية الواقعة بين عامي (1537 م – 1857 م).
مجموعة الحضارة الإسلامية
تزخر مكتبة الجامع بكل ما يعبر عن ثراء الثقافة الإسلامية من كتب ومصادر وتضم في مجموعة الحضارة الإسلامية، عددًا من المصادر المتميزة والقيمة المتخصّصة، في مواضيع الحضارة الإسلامية المختلفة مثل: التاريخ والثقافة، والفنون، والعمارة، والحدائق، والأدب والعلوم، والمخطوطات.
مجموعة الدوريات
للدوريات المتخصصة في الثقافة الإسلامية نصيب في مكتبة الجامع؛ حيث يضم قسم الدوريات عددًا من الدوريات القديمة والحديثة ومن أبرزها 32 عنوانا متميزا لدوريات كتبت ب 5 لغات مختلفة هي: الإنجليزية والفرنسية والألمانية إلى جانب الإسبانية والإيطالية، لم تخرج موضوعاتها إجمالا عن إطار اختصاص المكتبة في علوم الثقافة الإسلامية وفنونها عبر العصور.
مجموعة دولة الإمارات العربية المتحدة
تعنى مكتبة الجامع بإرث دولة الإمارات العربية المتحدة من تاريخ ومنجزات وشخصيات فذة كان لها دورها في تأسيس الدولة، ورفد مسيرة الاتحاد، ويظهر ذلك جليًا في تخصيصها قسمًا لكتب دولة الإمارات العربية المتحدة التي تطلع زوار المكتبة على تراث الدولة، وتاريخها ومآثر مؤسسيها، ودور قيادتها الرشيدة في تحقيق نهضتها في مختلف المجالات، وغيرها من الموضوعات ذات العلاقة.
مجموعة كتب الأطفال
إيماناً بالطفل والأجيال الناشئة، ودورها الفاعل في تحقيق تطلعات الوطن، وانطلاقا من أهمية خلق جيل قادر على صناعة المستقبل، من خلال توسيع مداركه، وتزويده بمفاتيح المعرفة والثقافة؛ عززت مكتبة الجامع العلاقة بين الطفل والكتاب، من خلال تخصيصها قسمًا للأطفال، يتيح لزوارها من الناشئة الاطلاع على مجموعتها المتميزة من كتب الأطفال.